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    金針菇HMG-box轉(zhuǎn)錄因子鑒定及一個(gè)候選基因的差異表達(dá)分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】孟麗 王麗 劉芳 丑天勝 王威謝 寶貴
    【機(jī)構(gòu)】山東農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院山東省農(nóng)業(yè)微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心
    摘要:食用菌的原基形成受到環(huán)境因子和內(nèi)源基因的共同調(diào)控,轉(zhuǎn)錄因子在其生長發(fā)育過程中能夠起到關(guān)鍵作用。本研究在已測(cè)序金針菇單核菌株L11全基因組中鑒定到29個(gè)高速泳動(dòng)蛋白(high-mobility-group box,HMG-box)轉(zhuǎn)錄因子編碼基因?;诮疳樄诫p核菌株H1123各發(fā)育時(shí)期轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選到一個(gè)與金針菇原基形成相關(guān)的HMG-box轉(zhuǎn)錄因子基因Fv-hmg。通過同源比對(duì)發(fā)現(xiàn)Fv-hmg的DNA序列在6個(gè)不同金針菇菌株中十分保守,一致性為98.38%,有92個(gè)SNP位點(diǎn)。克隆分析表明,該基因長度為1 517bp,含有一個(gè)內(nèi)含子。該基因編碼489個(gè)氨基酸殘基的蛋白序列,含有一個(gè)HMG-box結(jié)構(gòu)域。通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序共同分析表明,該基因在金針菇原基時(shí)期的表達(dá)量比雙核菌絲時(shí)期高達(dá)4倍以上,具有顯著性差異(P<0.01),由此推測(cè)該轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控金針菇的原基形成。HMG-box轉(zhuǎn)錄因子Fv-Hmg在金針菇原基形成過程中的作用仍需進(jìn)一步研究。 
     
    基金:國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(2014CB138302); 山東省自然科學(xué)基金(ZR2016CL13); 山東省農(nóng)業(yè)微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題基金(SDKL2017015)~~;
     
    關(guān)鍵詞:金針菇; 原基形成; 高速泳動(dòng)蛋白; 轉(zhuǎn)錄因子;
     
     
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