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    草菇基因組中11個漆酶同源基因的生物信息學(xué)分析及銅離子對其表達的影響


    【發(fā)布日期】:2019-01-21  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】吳林 朱剛 陳明杰 汪虹 鮑大鵬
    【機構(gòu)】國家食用菌工程技術(shù)研究中心 農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所上海海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院
    【摘要】通過分析草菇基因組中11個漆酶同源基因所編碼的蛋白的性質(zhì)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件和測定銅離子存在條件下的草菇漆酶活性及11個漆酶基因的轉(zhuǎn)錄水平,揭示了草菇漆酶基因的各自特性、差異以及基因功能與進化機制。分析表明,這11個漆酶同源基因編碼的蛋白具有508–562aa個氨基酸,分子量和理論等電點分別為56.25–60.75kDa和4.51–6.18(未經(jīng)翻譯后修飾),且都具有真菌漆酶銅離子結(jié)合區(qū)域的特征序列、4個能夠結(jié)合催化底物的環(huán)形結(jié)構(gòu)以及信號肽序列,都屬于分泌性的胞外蛋白,但其底物結(jié)合位點數(shù)目、loop序列的一致性、跨膜區(qū)域數(shù)目和位置以及信號肽位置等存在較大差異。草菇11個漆酶起始密碼子上游2 000bp的序列中含有真核生物的基本轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件(TATA‐box,CAAT‐box及GC‐box)和多個潛在的調(diào)控元件(MRE、XRE、STRE、HSE、ARE、TRE、NIT元件等),但每個基因所含調(diào)控元件數(shù)目及種類各有不同。在液體培養(yǎng)條件下,銅離子能夠誘導(dǎo)除vv‐lac2、vv‐lac3和vv‐lac7之外的其余8個草菇漆酶基因的表達,且適宜濃度的銅離子有助于草菇漆酶活性的增加。 
    【基金】上海市科技興農(nóng)重點攻關(guān)項目[滬農(nóng)科攻字(2011)第1‐2號]; 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技發(fā)展基金[農(nóng)科發(fā)2013(02)];
    【關(guān)鍵詞】草菇; 漆酶基因; 銅離子; 表達;
     
    關(guān)鍵詞: 草菇; 漆酶基因; 銅離子; 表達;
     
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